城市黑臭河道水体之所以呈黑臭水体状态，主要是过量纳污导致水体供氧和耗氧失衡，污染物再此条件下转化并产生氨氮、硫化氢、挥发性有机酸等恶臭物质以及铁、锰硫化物等黑色物质。河道“黑臭”产生的原因总体上来说主要有三个方面：

       一，部分河水系流动性差，造成水体呈死水状态； 

       二，治理黑臭水体中有机污染物超标（污水直排、偷排、漏排）； 

       三，水体中溶解氧不足，造成水体呈厌氧环境。

       综合以上三方面原因，外部环境充足的条件下，水体中原有的好氧微生物对有机物进行好氧分解，消耗大量的氧气，造成水体溶解氧不足形成厌氧环境，使得厌氧微生物大量繁殖，对水体中的有机污染物进行发酵，产生氨气、硫化氢、硫醇等多种发臭物质，逸出水面进入大气，直接刺激人的嗅觉器官，同时，水中铁、锰等重金属在厌氧条件下被还原，与水中的硫形成硫化物，形成大量黑色悬浮胶体颗粒，加上水体自身的色度，使其颜色为黑色或者泛黑色导致河流黑臭。